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新研究:生成式人工智能可快速 分析染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)

時間:2025-02-06 18:06:53 來源:經(jīng)濟參考報 發(fā)布者:DN032
染色質(zhì)是人體細胞內(nèi)遺傳物質(zhì)的載體,染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)差異會在一定程度上影響不同細胞的不同功能。美國一項新研究說,可利用生成式人工智能幫助分析染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu),比傳統(tǒng)實驗方法更加高效便捷。

據(jù)介紹,染色質(zhì)是細胞核內(nèi)由脫氧核糖核酸(DNA)和蛋白質(zhì)等形成的復(fù)合物,具備復(fù)雜結(jié)構(gòu),使得展開后約2米長的DNA鏈條能夠塞入直徑僅為百分之一毫米的細胞核中。染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)差異會導(dǎo)致被有效表達的基因不同,從而影響細胞功能。

傳統(tǒng)上通過實驗來分析染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的方法費時費力,需要約一周時間才能得到一個細胞的數(shù)據(jù)。美國麻省理工學(xué)院研究人員日前在美國《科學(xué)進展》雜志上發(fā)表論文說,利用生成式人工智能可快速、準(zhǔn)確分析細胞中染色質(zhì)結(jié)構(gòu),將這個時間縮短到若干分鐘。

研究人員開發(fā)出名為ChromoGen的人工智能模型,它由一個深度學(xué)習(xí)模型和一個生成式人工智能模型組成。前者經(jīng)過訓(xùn)練可“讀取”基因組,分析DNA序列和染色質(zhì)中的相關(guān)信息。后者則可根據(jù)相關(guān)信息給出染色質(zhì)結(jié)構(gòu),此前已用超過1100萬個染色質(zhì)結(jié)構(gòu)對其進行訓(xùn)練。當(dāng)二者集成時,可針對不同細胞環(huán)境,分析確定相關(guān)的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。

研究人員表示,這有助于更好地探索染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)如何影響單個細胞的基因表達模式和功能,從而推動生物學(xué)等領(lǐng)域研究。

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